Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms