Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms