Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms