Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms