Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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RABGEF1Q9UJ41 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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RABGEF1Q9UJ41 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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RABGEF1Q9UJ41 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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RABGEF1Q9UJ41 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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RABGEF1Q9UJ41 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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RABGEF1Q9UJ41 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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