Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHORDC1Q9UHD1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms