Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms