Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms