Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPASTQ9UBP0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms