Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL13Q9P2N7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms