Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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