Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKIRAS1Q9NYS0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms