Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms