Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms