Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms