Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms