Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRDM12Q9H4Q4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRDM12Q9H4Q4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRDM12Q9H4Q4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms