Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCSER1Q9C0I3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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