Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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FOXQ1Q9C009 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXQ1Q9C009 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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