Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms