Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms