Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms