Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF3RQ99062 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms