Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR78Q96P69 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms