Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms