Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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