Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF183Q96D59 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms