Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM54Q969K7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms