Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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CLIP4Q8N3C7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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CLIP4Q8N3C7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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CLIP4Q8N3C7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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