Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC84Q86UT8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms