Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms