Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms