Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms