Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC27A3Q5K4L6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC27A3Q5K4L6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms