Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KHDC3LQ587J8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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