Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms