Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms