Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms