Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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