Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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RTN1Q16799 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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RTN1Q16799 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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RTN1Q16799 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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RTN1Q16799 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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RTN1Q16799 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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