Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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