Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms