Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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PCSK7Q16549 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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PCSK7Q16549 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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PCSK7Q16549 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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