Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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