Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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