Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CST6Q15828 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CST6Q15828 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CST6Q15828 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CST6Q15828 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CST6Q15828 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CST6Q15828 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CST6Q15828 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CST6Q15828 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CST6Q15828 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CST6Q15828 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CST6Q15828 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CST6Q15828 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CST6Q15828 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CST6Q15828 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CST6Q15828 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CST6Q15828 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CST6Q15828 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CST6Q15828 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
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CST6Q15828 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CST6Q15828 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CST6Q15828 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CST6Q15828 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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