Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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