Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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