Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms