Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms